Caracterización molecular y morfológica de aislados bacterianos de piel de Ambystoma dumerilii con lesiones

Abstract

Ambystoma dumerilii is a microendemic salamander from Lake Pátzcuaro, Michoacán, considered critically endangered on the IUCN Red List, due to the serious deterioration of the lake, associated with different anthropic impacts such as pollution, introduction of exotic species and change of land use. This panorama makes it necessary to look for alternatives for their preservation, such as the maintenance of ex situ populations. However, even in captivity conditions, these populations are susceptible to emerging infectious diseases, which represent the main threat to amphibians worldwide. Therefore, in the present study, bacterial strains were isolated and characterized from the skin of individuals of the Ambystoma dumerilii species kept in captivity that presented skin lesions, in order to identify the causal agent of this disease. The isolated strains were identified by molecular methods using the V3-V4 region of the 16S ribosomal gene used as a universal marker for the taxonomic identification of prokaryotes. Bacterial isolates were morphologically characterized by scanning electron microscopy (SEM). In total, 20 bacterial colonies were isolated based on growth characteristics, from which 4 strains belonging to the Aeromonas genus, and 3 strains of the Acitenobacter and Pseudomonas genera were identified. Two bacterial isolates present high percentages of identity with sequences reported for the Acitenobacter johnsonii and Aeromonas salmonicida species, both registered with pathological properties in fish, which could be the cause of the disease present in Ambystoma dumerilii bred in captivity, this could compromise the survival of individuals making it difficult to preserve this species.

Ambystoma dumerilii es una salamandra microendémica del Lago de Pátzcuaro, Michoacán, considerada en peligro crítico en la Lista Roja de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (IUCN), debido al grave deterioro de las condiciones del lago asociada a diferentes impactos antrópicos como contaminación, introducción de especies exóticas y cambio de uso de suelo. Este panorama hace necesario buscar alternativas para su preservación, como es el mantenimiento de poblaciones ex situ. Sin embargo, aún en condiciones de cautiverio, estas poblaciones son susceptibles a las enfermedades infecciosas emergentes, que representan la principal amenaza para los anfibios en el mundo. Por lo tanto, en el presente estudio se aislaron y caracterizaron cepas bacterianas de la piel de individuos de la especie A. dumerilii mantenidos en cautiverio que presentaban lesiones cutáneas, con el objetivo de identificar el agente causal de esta enfermedad. Las cepas aisladas se identificaron mediante métodos moleculares utilizando la región V3-V4 del gen ribosomal 16S utilizado como marcador universal para la identificación taxonómica de procariontes. Los aislados bacterianos se caracterizaron morfológicamente mediante microscopia electrónica de barrido. En total se aislaron 12 colonias bacterianas con base en características de crecimiento, a partir de las cuales se identificaron 4 cepas pertenecientes al género Aeromonas y 3 cepas de los géneros Acitenobacter y Pseudomonas. Dos de los aislados bacterianos presentan altos porcentajes de identidad con secuencias reportadas para las especies Acitenobacter johnsonii y Aeromonas salmonicida, ambas registradas con propiedades patológicas en peces, las cuales podrían ser causantes de la enfermedad presente en Ambystoma dumerilii criados en cautiverio, esto podría comprometer la supervivencia de los individuos dificultando la preservación de dicha especie.