Estudio de la función molecular de la ubiquitina ligasa NFB1 de Neurospora crassa

Abstract

ubiquitin ligase complex SCF NFB1 was studied in Neurospora crassa. SCF complexes (Skp1-Cullina-fbox) participate in marking proteins called ubiquitin linking the peptide to the substrate proteins that will later be degraded. Ubiquitination and degradation of proteins is a form of enzyme regulation resulting in cell cycle regulation, regulation of specificity in signal transduction, development, regulation of transcription, and other biological processes. It was predicted that F-box protein is part of SCFNFB1 NFB1 complex and it is responsible for making a molecular recognition of substrates are ubiquitinated. Replacement of gene in N. crassa nfb1 the hygromycin cassette causes a reduction cremimiento aerial mycelium, reducing the production of biomass and sterility during mating. In order to know the molecular function of the protein NFB1 a bioinformatic study was conducted to predict potential SCFNFB1 white substrate complex. three potential substrates (ClnG1, NIME and NHOF1) for interaction with NFB1 where possible domains important for interaction is described encrontraron. The results show that these three proteins could be involved in cell cycle regulation. Additionally, molecular biology tools that will allow experimentally test the interaction between the protein and the substrate NFB1 hypothetical proteins were generated.

Se estudió un complejo tipo ubiquitina ligasa SCFNFB1 en Neurospora crassa. Los complejos SCF (Skp1-Cullina-Fbox) participan en el marcado de proteinas uniendo el peptido llamado ubiquitina a las proteínas sustrato que posteriormente serán degradadas. La ubiquitinación y degradación de proteínas es una forma de regulación enzimática que resulta en la regulación del ciclo celular, regulación de la especificidad en la transduccion de señales, desarrollo, regulacion de la transcripción, y otros procesos biológicos. Se predijo que proteína F-box NFB1 forma parte del complejo SCFNFB1 y ésta es la responsable de hacer un reconocimiento molecular de los sustratos que serán ubiquitinados. El remplazo del gen nfb1 en N. crassa por el cassette de higromicina ocasiona una reducción del cremimiento del micelio aereo, reducción de la produción de biomasa y esterilidad durante el apareamiento. Con la finalidad de conocer la función molecular de la proteína NFB1 se realizo un estudio bioinformatico para predecir los posibles sustrato blanco del complejo SCFNFB1. Se encrontraron tres sustratos potenciales (ClnG1, NIME y NHOF1) para la interacción con NFB1 en los cuales se describieron los posibles dominios importantes para la interacción. Los resultados muestran que estas tres proteínas podrían participar en la regulación del ciclo celular. Adicionalmente, se generaron las herramientas de biología molecular que permitirán probar experimentalmente la interación entre la proteína NFB1 y las proteínas sustrato hipotéticas.