Biodiversidad filogenética de actinomicetos aislados de Ichaqueo, Michoacán

Abstract

In Ichaqueo’s town, in the middle of a wooded area, 17 Km south of Morelia, Michoacan, at 2440 meters above sea level a waterfall named "Chorro Prieto” is located which is a suitable habitat for the development of actinomycetes. Actinomycetes are aerobic bacterias, Gram positive, filamentous, with branchings, and when they fragment they form coccoid or bacillar elements, and are widely distributed in the soil and other natural environments. Currently, actinomycetes are included on the bacteria domain due to several reasons: the cell wall is composed by peptidoglycan, the diameter of hyphaes are lesser than fungi, they are sensitive to antimicrobial but are resistant to antifungal agents, and their genetic material is prokariotic. Furthermore they are characterized by a high Guanine-Cytosine content in their DNA, being between 51 to 78%. Identification of isolated actinomycetes from the waterfall named "Chorro Prieto", Ichaqueo, Michoacan; was made according to the macroscopic and microscopic characteristics typical of the Actinomycetales. Sebsequently, biomolecular techniques were applied such as the amplification of a phylogenetic marker from Gram positive bacteria with a high content of Guane-Cytosine (also found in 23S rRNA gene), to prove that they belong to actinomycetales. Also the sequencing and amplification of 16S rRNA gene to complete the genetic identification and to made a phylogenetic analysis. Using the amplification of the phylogenetic marker (23S rRNA), it was proved that 34 out of 39 isolated strains belong to the order of Actinomycetales and by amplification of 16S rRNA gene the following genera were identified: Streptosporangium, Micromonospora, Rhodococcus and Streptomyces.

En la localidad de Ichaqueo, se encuentra ubicada la cascada “Chorro Prieto” en medio de una zona boscosa a 17 Km al sur de Morelia, Michoacán a 2440 msnm, siendo este un hábitat propicio para el desarrollo de actinomicetos. Los actinomicetos son bacterias aerobias Gram positivas, filamentosas, ramificadas, las cuales al fragmentarse forman elementos cocoidales o bacilares, estando ampliamente distribuidos en suelo, así como en otros ambientes naturales. En la actualidad, los actinomicetos se encuentran incluidos en el dominio bacteria debido a varias razones: su pared celular está compuesta por peptidoglicano, el diámetro de sus filamentos es inferior al de los hongos, son sensibles a los antimicrobianos pero son resistentes a los antifúngicos y su material genético es procariota, además se caracterizan por presentar un alto contenido de Guanina y Citosina en su DNA, encontrándose entre 51 a 78%. La identificación de los actinomicetos aislados de Ichaqueo, Michoacán, se realizó de acuerdo a las características macroscópicas y microscópicas propias de los actinomicetales, posteriormente se utilizaron técnicas de biología molecular como la amplificación de un marcador filogenético de bacterias Gram positivas de alto contenido de Guanina-Citosina (presente en el gen 23S rRNA), para comprobar que pertenecen al orden de los actinomicetales, así como la amplificación y secuenciación del gen 16S rRNA para realizar la identificación genética y la realización de un análisis filogenético. Con la amplificación del marcador filogenético presente en el gen 23S rRNA se comprobó que 35 de las 39 cepas aisladas corresponden al orden de los actinomicetales y con la amplificación del gen 16S rRNA se identificaron los siguientes géneros Rhodococcus, Micromonospora, Streptomyces y Streptosporangium.