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Title: Determinación de la presencia del gen cdh en Colletotrichum lindemuthianum (Sacc & Magnus) Lamb Scrib
Authors: Ramírez Valdespino, Claudia Adriana
Adviser: Martínez Pacheco, Mauro Manuel
Reyna López, Georgina Elena
Keywords: info:eu-repo/classification/cti/6
IIQB-M-2011-0014
Enzimas
Hongos
Genoma
Issue Date: Dec-2011
Publisher: Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo
Abstract: The cellobiose dehydrogenase (CDH) is an extracellular fungal oxide-reductase hemoflavoenzyme of biotechnological interest. In the fungus Colletotrichum lindemuthianum has been described the enzymatic activity type CDH, which showed a broad spectrum of substrates. So it is important to establish its correlation with the presence of the cdh gene in the genome of the fungus. With degenerate oligonucleotides designed from conserved sequences of homologous CDHs of ascomycetes, a sequence of approximately 500 base pairs was amplified, which shared an 87% similarity with the cdh I genes of N. crassa, 86% with that of S Macrospora, 55% with H. insolens, 36% with A. clavatus and 16% with S. bisbyi. As for some fungi that present the cdh gene, a double copy was detected in C. lindemuthianum. We determined the temporal expression of the cdh gene and the size of its transcript that is approximately 2500 base pairs, similar in size to the cdh genes described. The results of this work indicate that the cdh gene is present in the genome of C. lindemuthiamun and its expression and the enzymatic activity type CDH correlate.
La celobiosa deshidrogenasa (CDH) es una hemoflavoenzima óxido-reductasa fúngica extracelular de interés biotecnológico. En el hongo Colletotrichum lindemuthianum se ha descrito la actividad enzimática tipo CDH, que mostró un amplio espectro de sustratos. Por lo que es importante establecer su correlación con la presencia del gen cdh en el genoma del hongo. Con oligonucleótidos degenerados diseñados a partir de secuencias conservadas de CDH homólogas de ascomicetos, se amplificó una secuencia de aproximadamente 500 pares de bases, la cual compartió un 87% de similitud con los genes cdh I de N. crassa , 86% con el de S. macrospora, 55% con el de H. insolens, 36% con el de A. clavatus y un 16% con el de S. bisbyi. Al igual que para algunos hongos que presentan el gen cdh, en C. lindemuthianum se detectó una doble copia. Se determinó la expresión temporal del gen cdh y el tamaño de su transcrito que es de aproximadamente 2500 pares de bases, similar en tamaño a los genes cdh descritos. Los resultados de este trabajo indican que el gen cdh está presente en el genoma de C. lindemuthiamun y su expresión y la actividad enzimática tipo CDH correlacionan.
Description: Instituto de Investigaciones Químico Biológicas. Maestría en Ciencias en Biología Experimental
URI: http://bibliotecavirtual.dgb.umich.mx:8083/xmlui/handle/DGB_UMICH/3877
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