Evaluación de la actividad antifúngica de bacterias aisladas de suelos afectados por incendios subterráneos e inferencias genómicas de la cepa termotolerante Bacillus sp. AF12

Abstract

Plants are exposed to different types of biotic and abiotic stress throughout their lives. Biotic stress, such as that caused by pathogens, is an undesirable effect in crops of economic interest, it can cause from a decrease in their production to total loss. Infection by pathogenic fungi is one of the main and most frequent problems in agriculture, since species such as Botrytis spp. and Fusarium spp. They are of global interest, because they are present in various parts of the world, infecting a wide variety of crops. The most common technique to control these infections is through the application of combinations of chemical fungicides, which can induce resistance to these in the short term and also have repercussions on the environment, by contaminating soil and water. A potential alternative to the use of chemical fungicides is the application of plant growth promoting bacteria (PGPB) that they are able to control fungal infections. In the present work, the antagonism by diffusible and volatile compounds in vitro of 40 bacterial strains selected as thermotolerant was evaluated, of which 18 strains were identified through the sequence of the 16S RNA ribosomal gene, the Bacillus genus being dominant. In the antagonism tests by diffusible compounds, 8 strains with antagonistic activity towards Botrytis sp. 62c were found, while for the F. brachygibbosum 4BF species, only 2 isolates presented antagonism. On the other hand, no isolate showed antagonism towards Botrytis sp. 62c and F. brachygibbosum 4BF for volatile compounds.

Las plantas se ven expuestas a diferentes tipos de estrés biótico y abiótico a lo largo de su vida. El estrés biótico, como el causado por agentes patógenos, es un efecto no deseable en cultivos de interés económico, ya puede provocar desde una disminución en su producción hasta la pérdida total. La infección por hongos patógenos es uno de los principales y más frecuentes problemas en la agricultura, ya que especies como Botrytis spp. y Fusarium spp. son de interés mundial, debido a que se encuentran presentes en diversas partes del mundo infectando una gran variedad de cultivos. La técnica más común para controlar estas infecciones es a través de la aplicación de combinaciones de fungicidas químicos, las cuales, pueden inducir resistencia a estos a corto plazo y además tienen repercusiones en el ambiente, al contaminar suelo y agua. Una alternativa potencial al uso de fungicidas químicos es la aplicación de bacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPB por sus siglas en inglés) que son capaces de controlar las infecciones fúngicas. En el presente trabajo se evaluó el antagonismo por compuestos difusibles y volátiles in vitro de 40 cepas bacterianas seleccionadas como termotolerantes, de las cuales, 18 cepas se identificaron a través de la secuencia del gen ribosomal ARN 16S, siendo dominante el género Bacillus. En los ensayos de antagonismo por compuestos difusibles, se encontraron 8 cepas con actividad antagónica hacia Botrytis sp. 62c, mientras que para la especie Fusarium brachygibbosum 4BF, solamente 2 aislados presentaron antagonismo. Por otro lado, ningún aislado mostró antagonismo hacia Botrytis sp. 62c y F. brachygibbosum 4BF por compuestos volátiles.