Fungal diseases in wildlife have increased in recent years, causing a drastic decrease in populations and the extinction of species at the local and regional levels. The relationships that exist between microorganisms and the environments in which they develop play a fundamental role in the properties and processes of ecosystems. In amphibians, it has been reported that environmental changes are related to fungal diseases, as these factors enhance the risk of infection. However, the mycobiota of the skin of amphibians, also serves a function of protection against pathogens, so its study is important. Ambystoma dumerilii is a microendemic species from Lake Pátzcuaro threatened by anthropogenic activities, for which there is no information on microorganisms associated with the skin, although there are reports of the incidence of pathogenic fungi that threaten species of this genus. In the present study, the mycobiota of the skin of A. dumerilii was characterized, with the aim of determining the diversity of fungi and incidence of pathogens, by analyzing the region that corresponds to its2 by massive sequencing. The analysis of the sequences was carried out with the Quantitive Insights Into Microbial Ecology 2 program. The taxonomic assignment was made with the UNITE database. The results obtained indicate the presence of 543 OTUs belonging to 27 clades of fungi, of which ascomycetes represent the most abundant group. The presence of chytridiomycetes was recorded in some individuals, indicating that this group of fungi, which includes pathogenic species, does not occur generally in the skin of A. dumerilii. No significant differences were obtained in the composition of the fungal community throughout the year, although changes in the relative abundance of some taxa were detected, indicating seasonal changes in the mycobiota. These results have important implications for the conservation of the species and for the study of emerging diseases.
Las enfermedades por hongos en la fauna silvestre han incrementado en los últimos años, ocasionando una disminución drástica de las poblaciones y la extinción de especies a nivel local y regional. Las relaciones que existen entre los microorganismos y los ambientes en que se desarrollan juegan un papel fundamental en las propiedades y procesos de los ecosistemas. En anfibios, se ha reportado que los cambios ambientales están relacionados con las enfermedades fúngicas, ya que estos factores potencian el riesgo de infección. Sin embargo, la micobiota de la piel de los anfibios, también cumple una función de protección contra patógenos, por lo cual su estudio reviste importancia. Ambystoma dumerilii es una especie microendémica del Lago de Pátzcuaro amenazada por las actividades antropogénicas, para la cual no existe información sobre los microorganismos asociados a la piel, aunque existen reportes de la incidencia de hongos patógenos que amenazan a especies de este género. En el presente estudio se caracterizó la micobiota de la piel de A. dumerilii, con el objetivo de determinar la diversidad de hongos e incidencia de patógenos, mediante el análisis de la región que corresponde al ITS2 por secuenciación masiva. El análisis de las secuencias se llevó a cabo con el programa Quantitive Insights Into Microbial Ecology 2. La asignación taxonómica se realizó con la base de datos UNITE. Los resultados obtenidos indican la presencia de 585 OTUs pertenecientes a 27 clados de hongos, de los cuales los ascomicetos representan el grupo más abundante. La presencia de chytridiomicetos se registró en algunos individuos, indicando que este grupo de hongos que incluye especies patogénicas, no se presenta de manera general en la piel de A. dumerilii. No se obtuvieron diferencias significativas en la composición de la comunidad de hongos a lo largo del año, aunque se detectaron cambios en la abundancia relativa de algunos taxa, indicando cambios estacionales en la micobiota. Estos resultados tienen implicaciones importantes para la conservación de la especie y para el estudio de enfermedades emergentes.
