Análisis funcional de la proteína ChrA de Pseudomonas aeruginosa en Neurospora crassa

Abstract

Chromium is a chemical element in living beings is considered toxic as hexavalent ion, because it can cause changes in protein structure or to interact and alter the DNA. Bacteria different mechanism that allow counteracting the effects of this ion, such as DNA repair proteins or carrier protein of. The transmembrane protein of Pseudomonas aeruginosa CHRA has the function of ejecting chromate as a bacterial detoxification mechanism. Phylogenetic analysis revealed CHRA part of the super-transporter family CHR, this super family is divided into LCHR family which has an average size 400AA and contains 10 transmembrane segments. This family includes several dozen bacterial species different proteins and some fungi and yeasts (Neurospora crassa, Aspergillus nidulans, Ustilago maydis, Gibberella zeae). In the genome of the yeast Saccharomyces cerevisiae protein exists nonhomologous to eta. Except for two bacterial proteins, the function of members of the family LCHR unknown. As part of a phylogenetic study it was identified in the genome of Neurospora crassa, a homolog called ChrNC CHRA. This gene has two introns 1745nt and encodes a protein of 508 aa. The conformational analysis to determine its topology showed that a protein with eight or nine transmembrane domains and segments containing 6 or handles of which 3 are periplasmic and 3 cytoplasmic. The carboxyl terminal end was located in the cytoplasm while for the amino terminus was not determined with certainty its location.

El cromo es un elemento químico que en los seres vivos es considerado tóxico como ión hexavalente, ya que puede provocar modificaciones en estructuras proteicas o hasta interaccionar y alterar el DNA. Existen diferentes mecanismos en bacterias que permiten contrarrestar los efectos producidos por este ión, tales como proteínas reparadoras de DNA o proteína transportadoras. La proteína transmembranal ChrA de Pseudomonas aeruginosa tiene la función de expulsar cromato como un mecanismo bacteriano de destoxificación. El análisis filogenético de ChrA reveló que forma parte de la súper familia de transportadores CHR, esta súper familia se divide en la familia LCHR la cual tiene un tamaño promedio de 400aa y contiene 10 segmentos transmembranales. Esta familia incluye varias docenas de proteínas de diversas especies bacterianas así como de algunos hongos y levaduras (Neurospora crassa, Aspergillus nidulans, Ustilago maydis, Gibberella zeae). En el genoma de la levadura Saccharomyces cerevisiae no existe homólogo para eta proteína. Con excepción de dos proteínas bacterianas, se desconoce la función de los miembros de la familia LCHR. Como parte de un estudio filogenético se identificó en el genoma de Neurospora crassa, un homólogo de ChrA denominado ChrNC. Este gen de 1745nt tiene dos intrones y codifica para una proteína de 508 aa. El análisis conformacional para determinar su topología mostró que es una proteína con ocho ó nueve dominios transmembranales y que contiene 6 segmentos o asas de las cuales 3 son periplasmáticas y 3 citoplasmaticas. El extremo carboxilo terminal se localizó en el citoplasma mientras que para el amino terminal no se determino con certeza su ubicación.