Tipificación molecular de Escherichia coli enterotoxigénica, enterohemorrágica y enteroagregativa en Michoacán

Abstract

Intestinal infections are the leading cause of death in preschool children in Mexico, being pathogenic Escherichia coli bacterial agent main cause of diarrheal infections. However, a high percentage of these pathogenic strains go unnoticed as a cause of childhood diarrhea because of the difficulty of differentiating strains of normal flora. As a highly specific and sensitive to this problem, PCR assays enable rapid and reliable identification of different pathotypes. Objectives. molecular pathotyping of enterotoxigenic Escherichia coli, enterohaemorrhagic and Enteroaggregative. Materials and methods. biochemical identification and antibiotic resistance strains of Escherichia coli was performed subsequently genetic material from 100 isolates from Children's Hospital of Morelia Eva Samano Lopez Mateos and the State Laboratory of Public Health of the State of Michoacán (SEPS) was extracted, real-time PCR performed such samples for genes encoding virulence factors. Results. identifying 44% of samples corresponding to a pathogen group was achieved, 50% of these were enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), 41% corresponds to enteroaggregative Escherichia coli EAEC, while for the case of Escherichia coli (EHEC) not the presence of any strain was found, the remaining 9% are other pathotypes of Escherichia coli. We also found that isolates show considerable resistance to antibiotics of choice.

Las infecciones intestinales son la principal causa de muerte en niños de edad preescolar en México, siendo Escherichia coli patógena el principal agente bacteriano causante de infecciones diarreicas. Sin embargo un alto porcentaje de estas cepas patógenas pasan inadvertidas como etiología de la diarrea infantil debido a la dificultad de diferenciarlas de las cepas de biota normal. Como una solución altamente específica y sensible a este problema, los ensayos de PCR permiten la identificación rápida y confiable de los distintos patotipos. Objetivos. Patotipificación molecular de Escherichia coli enterotoxigénica, enterohemorrágica y enteroagregativa. Materiales y Métodos. Se realizó la identificación bioquímica y resistencia a antibióticos de cepas de Escherichia coli, posteriormente se extrajo material genético de 100 aislados provenientes del Hospital Infantil de Morelia Eva Sámano de López Mateos y del Laboratorio Estatal de Salud Pública del Estado de Michoacán (LESP), se realizo PCR en tiempo real de dichas muestras buscando genes que codifican para factores de patogenicidad. Resultados. Se logro la identificación de 44% de muestras correspondientes a algún grupo patógeno, el 50% de estas fueron Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC), el 41% corresponde a Escherichia coli enteroagregativa EAEC, mientras que para el caso de Escherichia coli enterohemorrágica (EHEC) no se encontró la presencia de ninguna cepa, el 9% restante corresponde a otros patotipos de Escherichia coli. También se encontró que las cepas aisladas presentan una considerable resistencia a los antibióticos de primera elección.