The chromate conveyor CHR superfamily consists of the family of large proteins and SCHR LCHR family of small proteins. In Bacillus subtilis 168 genome a pair of genes encoding proteins Chr3C Chr3N and belonging to the family SCHR, conferring resistance to chromate in Escherichia coli only when both proteins are expressed are located. Chr3N gene upstream of the gene encoding CHRS a protein having homology to proteins of the family of transcriptional regulators is LRP. Previously it has been found that the cloning of the gene together with CHRS resistance genes chr3NC chromate (CHRS-chr3N-chr3C) decreases the level of resistance from the level chromate conferred only by the pair of chr3NC genes. Additionally it was determined that the presence of CHRS represses expression of genes chr3NC while chromate induces the expression. To elucidate the mechanism of regulation of protein CHRS on chromate resistance genes, the aim of this study was to determine if the protein product of RHC gene binds to the promoter regions of genes chr3N RHCs and B. subtilis 168. initially by in silico analysis it was made a prediction of the probable tertiary structure CHRS, an amino domain containing the binding motif DNA HTH type indispensable to perform its regulatory function, and a terminal carboxyl domain were identified βαββαβ conformation of which probably takes place interaction with its effector, two typical structures of proteins Lrp. An analysis of the sequences of regulatory regions of the RHC-chr3N-chr3C genes identified a consensus sequence as a possible binding site CHRS, which was located in the regulatory region of the gene CHRS.
La superfamilia CHR de transportadores de cromato está compuesta por la familia de proteínas grandes LCHR y la familia SCHR de proteínas pequeñas. En el genoma de Bacillus subtilis 168 se localizan un par de genes que codifican las proteínas Chr3N y Chr3C, pertenecientes a la familia SCHR, que confieren resistencia a cromato en Escherichia coli únicamente cuando ambas proteínas se expresan. Río arriba del gen chr3N se encuentra el gen chrS que codifica una proteína que presenta homología con proteínas de la familia de reguladores transcripcionales Lrp. Previamente se ha encontrado que la clonación del gen chrS junto con los genes de resistencia a cromato chr3NC (chrS-chr3N-chr3C) disminuye el nivel de resistencia a cromato respecto al nivel conferido únicamente por el par de genes chr3NC. Adicionalmente se determinó que la presencia de chrS reprime la expresión de los genes chr3NC, mientras que el cromato induce dicha expresión. Para dilucidar el mecanismo de regulación de la proteína ChrS sobre los genes de resistencia a cromato, el objetivo de este trabajo fue determinar si el producto proteico del gen chrS se une a las regiones promotoras de los genes chrS y chr3N de B. subtilis 168. Inicialmente, mediante un análisis in silico se hizo una predicción de la probable estructura terciaria de ChrS, se identificaron un dominio amino que contiene el motivo de unión al DNA del tipo HTH, indispensable para llevar a cabo su función regulatoria, y un dominio carboxilo terminal de conformación βαββαβ donde probablemente se lleva a cabo la interacción con su efector, dos estructuras típicas de las proteínas Lrp. Un análisis de las secuencias de las regiones reguladoras de los genes chrS-chr3N-chr3C identificó una secuencia consenso como un posible sitio de unión de ChrS, la cual se localizó en la región reguladora del gen chrS.
