Caracterización por Multi Locus Sequence Typing de aislados de Salmonella enterica obtenidos de productos cárnicos y derivados lácteos provenientes de Michoacán

Abstract

Salmonella enterica is one of the main etiological agents of gastrointestinal diseases worldwide and is mainly associated with the ingestion of contaminated food , presenting high rates of morbidity and mortality. Control of salmonellosis requires monitoring strategies that allow early detection and proper characterization of the causative agent . Most epidemiological studies of Salmonella in Mexico and especially in the state of Michoacán , only report the incidence and serotypes present. A useful molecular tool in the study of bacterial populations is the Multi Locus Sequence characterization Typing ( MLST ) technique which includes amplification and sequencing fragments of housekeeping genes ( housekeeping ) whose products are involved in essential cellular functions. This technique enables the determination of phylogenetic relationships between strains as well as a global visualization of the distribution of the complex in a major clonal population analyzed , tracing dispersion processes . The objectives of this study were to determine the ST of Salmonella enterica strains isolated from meat and dairy products derived from the state of Michoacán , compare allelic profiles obtained with those of the other analyzed countries and assigned to a serogroup strains and clonal group unassigned strains by conventional serotyping . 72 strains of serotype Typhimurium ( 12) , Anatum (16 ) , Agona (13 ) and 31 strains not assigned to a serotype by conventional methods, isolated from meat and dairy products Michoacan collected during the period 2008 were used - 2011 .

Salmonella enterica es uno de los principales agentes etiológicos de enfermedades gastrointestinales en todo el mundo y se asocia principalmente con la ingestión de alimentos contaminados, presentando altos índices de morbilidad y mortalidad. El control de la salmonelosis requiere de estrategias de monitoreo que permitan la detección temprana y la tipificación adecuada del agente causal. La mayoría de los estudios epidemiológicos sobre Salmonella en México y en especial en el estado de Michoacán, sólo reportan la incidencia y los serotipos presentes. Una herramienta molecular muy útil en el estudio de poblaciones bacterianas es la caracterización por Multi Locus Sequence Typing (MLST), técnica que incluye la amplificación y secuenciación de fragmentos de genes de mantenimiento (housekeeping) cuyos productos se encuentran involucrados en funciones celulares esenciales. Esta técnica permite la determinación de las relaciones filogenéticas entre cepas, así como una visualización global de la distribución de los principales complejos clonales en una población analizada, trazando procesos de dispersión. Los objetivos del presente trabajo fueron determinar las ST de cepas de Salmonella enterica aisladas de productos cárnicos y derivados lácteos del estado de Michoacán, comparar los perfiles alélicos obtenidos con los de cepas analizadas con los de otros países y asignar a un serogrupo y grupo clonal, las cepas no asignadas mediante serotipificación convencional. Se utilizaron 72 cepas de los serotipos Typhimurium (12), Anatum (16), Agona (13) y 31 cepas no asignadas a un serotipo por métodos convencionales, aisladas de carne y productos lácteos del estado de Michoacán colectadas durante el periodo 2008 - 2011.