Caracterización y comparación de poblaciones de Phytopthora cinnamomi aisladas de raíz de aguacate con pudrición en México y Estados Unidos

Abstract

Root rot is one of the main diseases that affect avocado crops and Phytophthora cinnamomi is the pathogen most frequently associated with the disease. It has been estimated that in the state of California alone, crop losses caused by P. cinnamomi exceed 40 million dollars annually. In California they found two genetically distinct clades of A2 mating type isolates (A2 clade I and clade II), those belonging to clade II, were characterized by being more virulent and less sensitive to potassium phosphite (Fp), this clonal lineage could have been introduced to southern California from Mexico, however this is not proven. Therefore, the objective of the present study was to characterize current populations of Phytophthora cinnamomi collected in Michoacán, México from avocado root rot and compare them with isolates from California, United States. One hundred and seventy-one isolates from nine municipalities were obtained and the compatibility type of these was determined. The in vitro sensitivity to Fp and Mtx of 50 selected isolates of P. cinnamomi was evaluated, as well as their virulence in Nicotiana benthamiana leaves. From these 50 isolates, a subgroup of 10 that represented the phenotypic variation of the population of Mexico (MEX) was selected to perform virulence tests on avocado. These 10 isolates were compared with 10 selected in the United States of America (USA) based on their sensitivity to Fp and growth rate. Additionally, 25 isolates obtained from roots with rot, from the municipality of Zitácuaro, were analyzed as it is an area not previously studied and Phytopthora isolates different from P. cinnamomi obtained from avocado roots with rot, were characterized morphologically and molecularly and pathogenicity tests were performed.

La pudrición de raíz es una de las principales enfermedades que afectan al cultivo de aguacate y Phytophthora cinnamomi es el patógeno más frecuentemente asociado a la enfermedad. Se ha estimado que solo en el estado de California, EUA las pérdidas en cultivos causadas por P. cinnamomi superan los 40 millones de dólares anuales. En California encontraron dos clados genéticamente distintos de aislados de tipo de apareamiento A2 (A2 clado I y clado II), los pertenecientes al clado II, se caracterizaron por ser más virulentos y menos sensibles a fosfito de potasio (Fp), este linaje clonal podría haber sido introducido en el sur de California proveniente de México, sin embargo, esto no está demostrado. Por lo que el objetivo del presente estudio fue caracterizar poblaciones actuales de Phytophthora cinnamomi colectadas en Michoacán, México de raíces de aguacate con pudrición y compararlas con aislados de California, Estados Unidos. Se obtuvieron 171 aislados de nueve municipios y se determinó el tipo de compatibilidad de estos. Se evaluó la sensibilidad in vitro a Fp y Mtx de 50 aislados seleccionados de P. cinnamomi, así como su virulencia en hojas de Nicotiana benthamiana. A partir de estos 50 aislados se seleccionó un subgrupo de 10 que representaban la variación fenotípica de la población de México (MEX) para realizar pruebas de virulencia en aguacate. Estos 10 aislados se compararon con 10 seleccionados en Estados Unidos de América (EUA) en base a su sensibilidad a Fp y velocidad de crecimiento. Adicionalmente se analizaron 25 aislados obtenidos de raíces con pudrición, del municipio de Zitácuaro por ser una zona no estudiada anteriormente y aislados de Phytopthora diferentes a P. cinnamomi obtenidos de raíces de aguacate con pudrición, se caracterizaron morfológica y molecularmente y se realizaron pruebas de patogenicidad.